風暴席捲太平洋時，海洋生物學家陸時衍在科考船甲板上，發現了被巨浪捲來的神秘男子——林知寒。他渾身覆蓋著細密的銀藍色鱗片，指尖有半透明的蹼，鰓部還在微弱開合，顯然不是普通人類。

陸時衍冒險將他藏在實驗室的海水艙，林知寒醒來後失去記憶，只對深海發出的低頻聲波有本能反應，也無法長時間離開海水。陸時衍為他取名“知寒”，試圖幫他找回身份，卻引來秘密組織“海閣”的追查——他們認定林知寒是傳說中“太平洋底文明”的倖存者，想提取他的基因掌控深海。

為躲避追捕，陸時衍帶着林知寒潛入太平洋深處。途中，林知寒逐漸覺醒能力：能與巨型鯨類溝通，在萬米深海自由穿行，還能感知海底地質異動。他零碎的記憶里，總浮現一座發光的水下古城，以及一場毀滅文明的災難。

兩人在躲避“海閣”追捕的同時，聯手阻止了一次海底火山噴發引發的海嘯，也慢慢靠近林知寒的身世真相——他不是“倖存者”，而是太平洋底文明為延續火種，用遠古基因培育出的“新人類”。而陸時衍的家族，竟與百年前發現海底古城的科考隊，有着千絲萬縷的聯繫。