清軍試圖仗着船多，採取包圍和火攻戰。數十艘裝滿柴薪火油的小船，被點燃後順流而下，沖向振明軍艦隊。

“攔截火船！長桿撐開！水龍噴！”各艦軍聲嘶力竭地指揮着。小型戰船上的水兵們力用長桿將靠近的火船推開，或是利用船上裝備的、由匠作營特製的水龍（力噴水）噴水滅火。訓練有素的配合使得清軍的火攻收效甚微。

岸上的清軍炮台不斷轟鳴，試圖制振明軍艦隊。然而，黃得功早已派出搭載了陸戰隊員的運兵船，在炮火掩護下，於炮台側翼兵力薄弱實施了強行登陸。這些陸戰隊員同樣裝備了燧發銃和震天雷，戰犀利，迅速攻克了數座炮台，為艦隊打開了通道。

經過近兩個時辰的激戰，清軍水師損失慘重，殘部狼狽逃竄，岸炮台也多被摧毀。黃得功水師功地突破了清軍在淮河黃口的封鎖，龐大的艦隊如同決口的洪流，浩浩地駛了混濁洶湧的黃河！

“信號旗！通告全軍，我們已黃河！”黃得功看着後蜿蜒如長龍的艦隊，以及前方那更加開闊、卻也更加危機四伏的黃河水道，豪氣頓生，“目標，徐州以北的房村渡！那裡是虜軍重要的漕糧中轉站，給老子端了它！”

艦隊沿着黃河主航道，藉助風力與槳力，快速北上。黃得功採納了嚮導的建議，避開主流中淤積的沙洲，選擇水深足夠的航道前行。沿途遇到小的清軍水師或沿岸哨所，本不與其糾纏，直接以猛烈炮火開路，碾而過。

消息傳到北京，多爾袞再次震怒。他沒想到林慕義的水師竟有如此實力和膽魄，敢深黃河作戰！漕運乃清廷命脈所在，一旦被截斷，不僅前線大軍糧草不濟，連北京的供應都將大問題！他嚴令山東、北直隸各地加防範，並急調部分關寧軍沿黃河布防，甚至考慮啟用部分投降的原明軍水師將領，試圖在黃河上重建水師力量。

然而，黃得功本不給他們重整旗鼓的時間。數日後，水師主力突然出現在房村渡外。此時，渡口正停泊着數十艘滿載糧秣的漕船，岸上倉庫更是堆積如山。

沒有任何警告，也沒有任何試探。振明軍水師所有炮艦同時開火，將無數的炮彈和火箭（“飛天火”的艦載版）傾瀉到渡口和漕船隊中。剎那間，房村渡陷一片火海，炸聲連綿不絕，漕船被炸得木屑橫飛，糧食化為灰燼，衝天的火幾十裡外都清晰可見。

摧毀房村渡後，黃得功並不停留，艦隊繼續沿黃河西進，一路掃清軍漕運節點，兵鋒一度威脅到濟寧州。整個清廷控制的黃河下游漕運系，被這把從南方突然刺的利刃，攪得天翻地覆，近乎癱瘓。

北伐三路大軍，中路攻堅，東路奇襲，西路（水師）破，如同一架戰車的三個子，終於開始同步發力，相互策應。黃得功水師在黃河上的縱橫馳騁，不僅沉重打擊了清軍的後勤補給，極大緩解了中、東兩路正面戰場的力，更如同一柄抵在清廷咽的匕首，讓其到了來自水上的、前所未有的致命威脅。北伐的戰火，終於從陸地點燃，蔓延到了浩瀚的江河之上。