徐孝克生於南朝梁末，出東海徐氏，為南朝着名文學家徐陵的同父異母弟。東海徐氏自晉宋以來便是江東族，累世以文才與德行着稱，孝克自便浸潤於家學氛圍中。其母臧氏慈慧，對孝克影響至深，《陳書》載其“為父所，至孝”，早年便以純孝聞名鄉里。梁代儒學雖玄學與佛理衝擊，然學未廢，孝克自塾，遍習五經，尤《周易》。他天資聰穎，過目誦，且善思辨，常於同窗論難中出新意，時人嘆其“慧天，非積學所能逮”。及長，他遊學建康，與當時名士袁憲、張譏等遊，清談之風漸長，其辯才初鋒芒，為士林所矚目。

太清二年（548年），侯景之如野火燎原般發，建康城在熊熊戰火中淪陷，梁朝的江山社稷搖搖墜。在這場慘烈的戰中，徐孝克的家庭遭遇了巨大的變故，他的父兄被迫離散，各自逃亡，而家中年邁多病的母親臧氏則無人照料，生活陷了極度的困境。

面對如此艱難的局面，徐孝克毫不猶豫地挑起了家庭的重擔。他深知母親的狀況不佳，需要悉心照料，於是他毅然決定減自己的飲食，將節省下來的食供奉給母親。每天，他自己僅僅食用一碗稀粥，卻把最好的食留給母親。不僅如此，他還變賣了家中的，換取母親所需的湯藥。

《陳書·孝行傳》中詳細記載了徐孝克在這段時期的孝行：他日夜守候在母親邊，不解帶，親自侍奉湯藥。由於長期的勞累和營養不良，他的變得形容枯槁，但他的母親的病卻在他的悉心照料下逐漸好轉。他的孝順之舉傳遍了戰中的江南大地，人們無不為之。

然而，局勢日益危急，糧食短缺的問題愈發嚴重，徐孝克意識到，僅憑自己的努力已經難以同時照顧好母親和維持家庭的生計。在經過深思慮之後，他做出了一個令人震驚的決定——剃度出家，投佛寺。

在南北朝時期，僧尼可以得到寺院的庇護，同時還能免除徭役。對於徐孝克來說，這無疑是在世中保護母親的一種無奈選擇。他在《與臧母書》中寫道：“我空門，並非是忘記了親，而是希能夠保全母親的命啊。”這句話充分現了他心的痛苦和無奈，以及他對母親深深的孝順之。

出家之後，徐孝克並沒有荒廢學業。相反，他充分利用佛寺中的藏書資源，潛心鑽研佛典和《周易》等經典着作。通過不斷地學習和思考，他將儒家的義理與佛教的教義融會貫通，不僅在學上取得了顯着的就，而且他的清談技藝也越發湛。

承聖三年（554年），梁元帝在江陵城被西魏大軍攻破後，自焚而死，梁朝宣告覆滅。與此同時，陳霸先在江南地區崛起，他率領軍隊平定了各地的叛，逐漸統一了江南地區，使得社會秩序逐漸恢復穩定。

在這個的時期，孝克因為母親思念他，決定放棄出家修行的生活，還俗歸家。當時的人們對他的這一舉給予了高度評價，稱讚他“既能在世中保全孝道，又能在治世時回歸世俗，這種進退自如的行為實在是令人欽佩”。

永定元年（557年），陳霸先廢掉了梁朝的最後一位皇帝，建立了陳朝。此時，徐陵已經在朝廷中擔任了重要職務，位高權重。由於孝克的才學和孝名遠揚，他被徐陵舉薦為太學博士，從此正式踏仕途。

孝克為清廉，不貪圖榮華富貴和名利。在擔任太學博士期間，他致力於整頓學風，獎勵和提拔有才華的後輩學子，因此深學生們的敬重。

到了陳文帝天嘉年間，孝克被升遷為國子助教，負責講授《周易》這門課程。他的授課方式深淺出，常常引用佛教的義理來印證儒家的教義，使得學生們能夠更好地理解和掌握知識。每次他講課的時候，前來聽課的人常常多達數百人，甚至導致了館舍都無法容納這麼多學生的況。