阿爾瓦拉多佔領危地馬拉高原後，向東進薩爾瓦多地區。

薩爾瓦多地區位於危地馬拉的東南部，地形以山地為主，與危地馬拉一樣也有很多火山，最高的聖安娜火山海拔2380多米，氣候與危地馬拉南部地區差不多。居住在薩爾瓦多地區的印第安人主要是瑪雅人、皮皮爾族人、倫卡人，從事漁獵、農耕，過着原始部落的生活，各部落還經常為了爭奪土地發生衝突。

阿爾瓦拉多率部進薩爾瓦多地區後，境的印第安人起抵抗，但在遭到西班牙人的打擊後，才知道自己的石本打不過手持鐵的侵者，只得暫時屈服。

西班牙人佔領薩爾瓦多地區後，來到了聖薩爾瓦多山下一個皮皮爾族人的蘇哥托托村（Sukototo，即今蘇奇托托鎮（Suchitoto）），他們在這裡發現土著人在用一種西奎利特（Xiquilite）的植製作藍的染料（屬靛藍系料），這種料看上去十分靚麗，於是西班牙人將土著人製作的染料掠走，運回西班牙售賣，發現價格竟然比黃金還貴，蘇哥托托村就了西班牙靛藍染料的生產基地。

西班牙人佔領薩爾瓦多地區後，將這裡稱為新西班牙總督區（1521年設立）的“庫斯卡特蘭”。嘉靖四年（1525年），西班牙人在蘇哥托托村附近建造了“聖薩爾瓦多城”（San Salvador），作為庫斯卡特蘭的首府（歷史上，薩爾瓦多獨立後，1854年發生了強烈地震，聖薩爾瓦多城被毀，薩爾瓦多人在舊城附近重建了聖薩爾多瓦城）。

嘉靖六年（1527年），西班牙撤銷了“庫斯卡特蘭民區”，將薩爾瓦多地區劃歸危地馬拉都督府管轄。

嘉靖九年（1530年），阿爾瓦拉多被任命為危地馬拉都督。同年，西班牙人在聖薩爾瓦多城東115公里的聖米格爾火山附近發現了金礦，於是建造了聖米格爾城（San Miguel）。

嘉靖十六年（1537年），薩爾瓦多的印第安人因不堪忍民者的殘酷迫，發了大規模起0義，遭到了西班牙民當局的腥鎮0。

嘉靖三十六年（1557年），西班牙人在聖薩爾瓦多城西北50公里的地方建聖安娜城（Saint Anna，也稱Santa Ana）。

阿爾瓦拉多征服危地馬拉、薩爾瓦多地區時，科爾特斯於嘉靖二年（1523年）一月派部將克里斯托瓦爾·德·奧利德（Cristobal de Olid）走海路遠征洪都拉斯。

洪都拉斯地區位於危地馬拉、薩爾瓦多東部，北臨加勒比海，南瀕太平洋，全境主要以山地為主，山間多谷地，沿海有平原，以熱帶雨林氣候為主，年降水量在3000毫米以上。土著居民以阿查帕斯人為主，他們分屬十幾個城邦國。

奧利德命後，率120名西班牙士兵、250名阿茲特克人，從韋拉克魯斯離開墨西哥，走海路，到古島的哈瓦那。奧利德出發前，科爾特斯已派他的親信阿隆索·德·孔特雷拉斯（Alonso de Contreras）前往哈瓦那購買馬匹。奧利德到達哈瓦那後，找到了孔特雷拉斯，孔特雷拉斯已將馬匹、給養都準備好了。

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