萬道學宮大門敞開，問心鏡高懸，篩選着心懷至誠、品堅韌的求道者。然而，初元界生靈億萬，種族繁多，稟賦各異，所擅所長亦是天差地別。若以單一法門強授之，無異於削足適履，非但不能就大道，反而可能扼殺天，埋沒良才。

青玄道人高瞻遠矚，早已悉此節。故而在學宮部架構之上，他並未設定統一的修行路徑，而是依據初元界現存的主要修行路向與生靈的不同特質，大致劃分了三大主流院系，旨在“因材施教”，讓每一位學子都能找到最適合自己的道途。

其一，神魔院。

此院坐落於學宮東部區域，建築風格宏大獷，多以巨岩壘砌，散發出古老而磅礴的氣息。院主要傳授由先天神魔開創、並不斷完善的神魔大道。此法門最適合那些天生強橫、氣旺盛，或是極其親近某種天地法則（如庚金、玄冥、離火等）的生靈修行，例如部分妖族、巫族後裔、先天靈，乃至一些天賦異稟的人族修。

神魔院的傳承，側重力之法則的深挖掘與運用，追求一力破萬法，天地。核心課程包括引星辰之力或地脈煞氣淬鍊神魔之軀的《星辰鍛訣》、《煞氣煉法》；蘊含無上戰意的近搏殺戰技，如《八荒戰舞》、《裂空九擊》；以及如何將自脈或天賦神通與對應法則深度融合，最終走向聖，不朽不滅的至高法門。在此院修行者，往往氣勢迫人，舉手投足皆有莫大威能。

其二，萬法院。

此院位於學宮中央核心區域，樓閣亭台最為集，飛檐斗拱，雕樑畫棟，充滿了智慧與秩序的。院傳授源自洪荒玄門道統（主要是截、闡兩教義），又經過初元界本土演化、去蕪存菁後的種種鍊氣法門。這是系最為龐雜的一個院系，囊括萬千，故名“萬法”。

萬法院主要面向那些悟較高、心思靈、善於思考和控能量的生靈，如大部分人族、部分妖族及怪。其傳承以元神修鍊、鍊氣化神為核心基，在此基礎上，衍生出繁複而深的陣法（布陣、破陣、陣道推演）、丹（煉丹火候、藥材配伍、法煉製、符文銘刻）、符籙（符膽凝聚、虛空畫符、符陣結合）、卜算（推演天機、趨吉避凶）等百藝之學。弟子可據自興趣與天賦，選擇主修與輔修方向，窮究一道或兼修數門，旨在以智慧駕馭萬法。

其三，自然院。

此院坐落於學宮西部，依山傍水，環境清幽，建築多與自然相融，以竹木、藤蘿為材，充滿了生機與禪意。院側重於悟天地自然、草木枯榮、生死迴的自然之道。此道最適合那些心平和、不喜爭鬥、天生親近自然萬的生靈，如木靈、部分水系妖族、一些追求心靈寧靜的人族或怪。

自然院的修行，更重“悟”而非“煉”。弟子需觀察四季更迭，風雨雷電，味生命從萌芽到凋零的整個過程，從而明悟循環、平衡與和諧的至理。院亦包含實用的醫道（以自然之力療傷祛毒）、靈植（培育優化各種靈藥仙草）、馴（與靈通，建立夥伴關係）等知識。修行此道者，往往氣息純凈，能與周圍環境融為一，於無聲聽驚雷，於平凡中見大道。

此外，學宮還設有諸多輔修、雜學課程，如洪荒通史、初元地理、種族文化、音律、書畫、甚至基礎的治理之學等。青玄鼓勵學子在修本院道法之餘，博採眾長，類旁通。一位神魔院的弟子，或許可以輔修萬法院的陣法，以陣道強化己；一位萬法院的符籙天才，或許能從自然院的醫道中領悟生命符文的奧妙。

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