晉紀三十六，從公元405年（乙巳年）到公元408年（戊申年），共四年。

義熙元年（公元405年，己巳年）

春天正月，南太守扶風人魯宗之起兵，去襲襄，桓蔚抵擋不住，逃到江陵。正月己丑，劉毅等各路大軍開到馬頭。桓振挾持着皇帝，出城駐紮在江津，還派使者來，說要割讓江、荊二州，送回皇帝，劉毅他們沒答應。正月辛卯，魯宗之在柞溪把桓振的將領溫楷打得大敗，接着進軍駐紮在紀南。桓振留下桓謙、馮該守江陵，自己帶兵去和魯宗之戰，結果又被打得落花流水。劉毅等人在豫章口打敗了馮該，桓謙一看形勢不妙，棄城逃跑。劉毅他們順利進江陵，抓住卞范之等人，砍了腦袋。桓振往回趕，遠遠看見江陵城裡起火，知道城已經被攻陷，手下的兵一下子都跑了，他自己逃到涢川。

正月乙未，皇帝下詔，把重大事務都給冠軍將軍劉毅理。

正月戊戌，宣布大赦天下，改年號，但桓氏家族不在赦免範圍。不過因為桓沖對晉朝皇室一直忠心耿耿，所以特別赦免了他的孫子桓胤。朝廷任命魯宗之為雍州刺史，璩為征西將軍，都督益、梁、秦、涼五州諸軍事，璩的弟弟瑾為梁、秦二州刺史，瑗為寧州刺史。劉懷肅追到石城，把馮該給殺了，桓謙、桓怡、桓蔚、桓謐、何澹之、溫楷這些人都逃到後秦去了。桓怡是桓弘的弟弟。

後燕的慕容熙去攻打高句麗。正月戊申，進攻遼東。眼看城就要被攻破了，慕容熙卻命令將士們：“誰都不許先登城，等把城牆剷平了，朕和皇後坐着車進去。”就因為這，城裡的人得到機會加強防備，最後慕容熙沒攻下城，只能灰溜溜地回去了。

秦王姚興把鳩羅什尊為國師，像敬神一樣供奉他。姚興親自帶着大臣們和和尚們，去聽鳩羅什講解佛經，還讓鳩羅什翻譯西域的《經》《論》三百多卷。又大規模修建塔寺，坐禪的和尚常常有上千人。從公卿以下的員都信奉佛教，州郡的老百姓影響，十戶裡面有九戶都信佛。

乞伏乾歸去攻打吐谷渾的大孩，把他打得大敗，俘虜了一萬多人回來。大孩逃跑的時候，死在了胡園。視羆的大兒子樹干，帶着剩下的幾千戶人逃到莫何川，自稱車騎大將軍、大單于、吐谷渾王。樹干減輕徭役和賦稅，賞罰分明，吐谷渾又興盛起來，沙、漒等地的各數民族都歸附了他。

西涼公李暠自稱大將軍、大都督，兼任秦、涼二州牧，宣布大赦天下，改年號為建初，還派舍人黃始、梁興走小路，帶着奏表去建康。

二月丁巳，留台準備好皇帝出行的車駕，到江陵去迎接皇帝。劉毅、劉道規留在夏口駐紮，何無忌護送皇帝往東回朝。

當初，璩聽說桓振攻陷了江陵，就帶着三萬人馬順流東下，準備去討伐桓振。他讓弟弟西夷校尉瑾、蜀郡太守瑗從外水出發，參軍西人譙縱、侯暉從涪水出發。蜀地的人本來就不想跑那麼遠去打仗，侯暉到了五城水口，就和西人昧商量着造反。譙縱這人格溫和謹慎，蜀地的人都喜歡他。侯暉和昧一起譙縱當頭兒，譙縱不答應，還跳到水裡想躲開。他們把譙縱拉出來，拿着兵他上車，譙縱又趴在地上，拚命磕頭推辭。侯暉沒辦法，就把譙縱綁在車上。然後他們轉頭回去，在涪城襲瑾，把瑾殺了，推舉譙縱為梁、秦二州刺史。璩行軍到略城，聽說出了事，趕往回跑回都，派參軍王瓊帶兵去討伐譙縱，結果被譙縱的弟弟譙明子打得大敗，士兵死了十有八九。益州的營戶李騰打開城門，放譙縱的兵進城，把璩和他弟弟瑗都殺了，家就此滅門。譙縱自稱都王，任命堂弟譙洪為益州刺史，譙明子為州刺史，駐守白帝。這一下蜀地大，漢中地區兵力空虛，氐王楊盛派他哥哥的兒子平南將軍楊去佔領了漢中。

二月癸亥，北魏主拓跋珪從豺山回宮，撤銷了尚書的三十六曹。

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