之前為什麼督能夠對於手下的大將們隨意指使，不僅僅是因為文貴武賤，更重要的是對於這些大將們來說，督們手上是握着他們的命門的，從某種意義上說，對於這些大將們來說，督們確實是有着生殺予奪的大權的，要知道所謂的總督巡，並不是名詞，而是一個詞，從某種意義上來說，督、經略、督師等職務都只是一個差遣，並不是實際的名。

所謂督等，最開始只是一個臨時差遣，到了後來為大明的封疆大吏，而督等員本質上是朝廷派出的欽差特使，只不過在權力上有所區別罷了，督和經略屬於部院的外差，按照大明的制度，一般巡是以都察院右僉都史和兵部、戶部右侍郎兼任，總督是以右都史、兵部尚書或者南京兵部尚書兼任，經略一般更加偏重軍務，則是以兵部尚書充任，而督師則是閣的外差，這些大員們到地方原本是為了統籌戰事，並不是常設職務。

但是後來已經為了常設職務，地方長，他們對於地方文武的控制就越發的嚴格了。因為這些督大員們對於提督總兵是有着生殺予奪的權力的，督等員，不僅僅是朝廷的封疆大吏，同時也是都察院的高級言，這點是非常之重要，大明的言權力極重，這些高級言更是如此，他們的彈章對於這些提督、總兵來說絕對是致命的，朝廷的本意是授予這些督以都察院職務，來加強朝廷對於地方的監察。

但是實際況就是這些督們所擁有的權力過重，他們所擁有的監察權實質上已經為了對於總兵、提督的任命權，這是導致文武關係失衡的一個重要的因素，人事即政治，這點朱載坖還是很清楚的，朱載坖認為現在督對於提督總兵的職務任免上話語權過重，這就會導致藩鎮化。

朱載坖要求制定督則例，將督的職權予以規定，尤其是督在人事權的作用要予以削弱，之前朝廷的文武不和的時候經常採用的做法是懲武或者將其調任，朱載坖認為嗣後涉及到文武不和的事，必須要召集勛臣武將、參贊軍務大臣和閣部重臣們一道商量在，這點是很重要的，

其實就是嚴格文武員的任免權限，督等大員作為封疆大吏，他們的權威確實是應該得到保證，但是朝廷在人事上的權力同樣要得到保證，對於各級文武員，督等只有監察、彈劾，在得到朝廷授權或者急況之下，可以予以停職等分，但是必須要朝廷的命令之後才能夠予以理，這些都是朝廷的權力，這點是不容挑戰的。

朱載坖要求將各級各級文武的任免權限予以上收，不僅僅是州縣正印是朝廷命，不能隨意罷免，各級武也同樣是朝廷命，不能隨意予以罷黜，這點也是一樣的，同時朱載坖還要求嚴武的調任制度，將各級武也要和州縣員一樣的實施到任制度，不能長期在一個地方任職、升遷，這就很容易導致出現出現武集團。

朱載坖已經實施了武學制度，日後大部分的基層武都是通過武學培訓出來的，而中高級武也要經常調回朝廷在國子武學予以培訓，實施武訓制度，各鎮各都司的各級武，都要在一定年限之後予以調任，防止出現尾大不掉的況，而對於督，則更多的是控制後勤和監察權，雖然朱載坖對於督的權力予以了限制，但是作為大明的封疆大吏，督仍然備對於治下的文武員進行彈劾、停職和監察的權力。

到武上，督們可以對這些武們實施監察，主要是對於武的貪墨行為予以核查，核實軍籍，管理軍儲和後勤，對於轄區部武的各種無法行為予以監察，糾劾，同時在急況和得到朝廷授權之後可以直接對武予以罷黜，送衛尉寺審斷等措施，衛尉寺作為大明的軍事司法機關，和大理寺一樣，要履行作為司法機關的職能。

除此之外，朱載坖對於番將的問題還是採取了措施準備予以解決的，首先對於番將本，他們勇敢善戰，為大明立下了赫赫軍功，有功必賞這是朱載坖的原則，不能因為要防範番將就對他們的軍功視而不見，朱載坖認為對於這些立下了軍功的番將，在賞賜和升遷上不能有所折扣，但是要加強對於這些番將的教育，他們往往缺乏教育，所以朱載坖決定將現在軍中的番將流選送武學中進行教育，通過這種方式加強番將的忠誠度。

同時實施換制度，將這些番將打散安置，任職，防止出現番將抱團，把持軍的況，當然更重要的還是提升武學培訓出來的軍的能力，這點也是非常之重要的，朱載坖命令從各級武學中調優秀軍，與京營等部的援軍一道，前往西域、趾和倭國等有戰事的地方，通過實戰換，從中發現有才能的軍，保證大明軍的指揮能力不下降。

除此之外，朱載坖覺得對於朝廷的機構予以改革，以適應現在朝廷的管理了，在之前朱載坖為了推行新政，設立了很多衙門，他們大多依附於六部存在，被視為一個臨時衙門或者是六部的附屬，在當時的況之下，確實是可行的，但是隨着實際況的變化，現在這些原本作為臨時機構的部門，他們的地位和作用已經和六部不想上下了，再冠以一個臨時衙門的稱號，似乎是不合理的，這點朱載坖是很清楚的。

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