朱載坖認為，可以藉此事加強朝廷對於烏斯藏的控制，要使得朝廷重視有關活佛選拔的事，在烏斯藏的政治生活中，宗教是很重要的一件事，這些活佛在當地有非常大的影響力，這點即便是朱載坖這個皇帝也不得不重視，烏斯藏的政治和宗教聯繫是極為的，所以朱載坖對於活佛的選任也要加強控制，以保證大明對於烏斯藏的控制。

這點朱載坖是很清楚的，所以朱載坖專門召見了禮部尚書陳經邦和大學士羅萬化，他們都是善於理外和藩屬問題的臣子，這次朱載坖要以索南加措的後事為抓手，介烏斯藏，理藩院要發揮應有的作用。要制定相應的規矩，重點在於朝廷直接參与對於活佛的擇立，這點是朱載坖的意圖。

羅萬化等人當然也明白這個意思，朝廷要通過對於活佛選擇的干預，加強對烏斯藏的控制，不過朝廷的干涉也要有度的，畢竟這些活佛和他們背後的宗教、土司勢力在當地勢力強勁，所以朝廷要達到一個平衡。

朝廷的目的是使得烏斯藏和外蒙古的喇嘛教互不統屬，而都轄於朝廷，猶江漢朝宗於海，加強對於蒙古和烏斯藏的控制，同時對於地方勢力加以抑制，在羈縻的基礎上逐漸增加朝廷的影響力。

說白了，就是要在喇嘛教部建立起一套在國家控制之下的選拔宗教首領繼承人的領導人選拔制度。說白了就是一種集權，朱載坖認為，要實施金瓶掣籤制度，其實就是加強集權，將原本依附於地方勢力的宗教集團，以金瓶掣籤制度為紐帶，集中到了朝廷的掌控之下，羅萬化等人也充分理解了朱載坖的意圖，不管是朱載坖提出的金瓶掣籤還是之前朝廷所設想的一系列方案，都是方式的不同罷了，本質上都是加強朝廷的控制力罷了。

朱載坖所提出了金瓶掣籤制度，其實也就是對於這些地方宗教勢力加以管理的手段罷了，按照朱載坖的想法，金瓶掣籤的第一步一樣是尋訪轉世靈，朱載坖在和理藩院以及相關的重臣們商量之後認為，在這一步應該重視尊重當地的風俗，朝廷不過多的干涉，這樣的話，可以儘可能的減當地對於朝廷政策的抗拒。

而在的選擇轉世靈的候選人中，朝廷不多加以干涉，而是充分尊重烏斯藏本地的風俗，一般由當地的髙僧通過誦經禱祝觀察天象等等宗教儀式，得到一個神諭，指示出轉世靈所在地的方位。然後再通過對所指示的方位某一自然景觀，建築等進行進一步的觀察，得出轉世靈所在地的信息。而在尋到轉世靈的候選人之後，必須讓靈對轉世活佛生前所用法等進行辨認以確認是否有靈參加掣籤。

到金瓶掣籤本，由監製造以用於選擇轉世靈的金瓶，由朱載坖賜予理藩院，而理藩院則是負責進行金瓶掣籤的主要部分，按照羅萬化等人所制定的規則，參與金瓶掣籤的有理藩院員、當地的朝廷最高軍政長、土司頭人、還有宗教領袖，在所有人的見證之下經過宗教儀式選出相應的轉世靈。

按照羅萬化等人所設計的辦法，所有人到齊之後，先將尋訪出的靈生辰分別用蒙、漢、藏文寫在特製的象牙籤片上，並用黃紙包好放金瓶蓋好，然後開始做掣籤之前的宗教儀式。由當地的高僧大德進行幾晝夜不停的宗教禱祝儀式後，儀式的主持者當眾用出一簽，以確定轉世靈。整個過程都是為了現宗教的權威，同時也在客觀上杜絕了徇私舞弊的可能，保證了籤的公正。

而掣籤的結果由在場的所有人簽字名確認之後，上奏朝廷，經由理藩院審核之後，上奏朱載坖，由皇帝批之後才能夠正式為被朝廷認可了的轉世靈，只有在皇帝批同意了之後，在朝廷批准之後才可以按照佛教儀式，正式給轉世靈舉行戒儀式。

而從轉世靈到活佛，還需要一個重要的宗教儀式，就是坐床，只有經過坐床之後，轉世靈才能夠變真正意義上的活佛，對於對於活佛的教育，朝廷也要手，不僅僅要接宗教教育，還要求到京師來朝見天子，接教育，大明派駐相應地方的員也要負責對於活佛的教育，使得他們能夠忠君國，坐床儀式也要在理藩院和當地最高軍政長的見證之下進行，從而為真正的活佛。

朱載坖命令理藩院制定相關的條例，同時要確定那些活佛是要有金瓶掣籤來決定的，同時在特殊況下，可以免予通過金瓶掣籤來決定，免於掣籤一般必須得到地方最高軍政長與地方宗教首領、土司頭人的一致同意，上報理藩院，轉報皇帝最後決定，是否舉行掣籤儀式。

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