對於這個問題，左都史海瑞認為于謙應當配太廟，原因很簡單，雖然英宗皇帝確實殺了于謙，但是實在徐有貞等一幫佞的欺騙之下才作出的決定，英宗皇帝事後也非常之後悔，英宗在生前也說過：“于謙實有功。 于謙始終景泰朝，被遇若一，死無餘貲。”

而且憲宗皇帝在為于謙平反的詔書中也明確說道：“卿以俊偉之，經濟之才，歷事先朝，茂着勞績。當國家之多難，保社稷以無虞；惟公道而自持，為機之所害。在先帝已知其枉，而朕心實憐其忠。”

孝宗皇帝在上諭中也明確說道：“于謙氣稟剛明，才優經濟，兼資文武，茂着聲猷，當皇祖北狩之時，正國步難危之日，乃能殫竭心膂，保障家邦，選將練兵，摧鋒破敵，中外賴以寧謐，人心為之晏然，迴鑾有期，論功應賞，不幸為權所構，乃隕其，輿議咸冤。”

大明數代先帝都肯定了于謙的功績，此事天下皆知，若是朱載坖對此事遮遮掩掩的話，反而會讓人家覺得朝廷心虛，所以于謙配太廟，是當之無愧的。海瑞的這個觀點也得到了張居正的支持，他也認為這是綱常氣節制所在，朝廷正好用此來激勵士子們報效國家。

朱載坖也認為正當如此，不僅僅是要肯定於謙的功勞，更加重要的是要藉由此事肯定肅宗皇帝的功績，雖然朱載坖為肅宗皇帝上了尊號，但是在大明的皇帝中，肅宗似乎仍舊有些名不正言不順的意思，朱載坖正好利用這次功臣配太廟的機會，為肅宗皇帝正名。

所以朱載坖當即決定，于謙配肅宗皇帝廟庭。

除此之外，朱載坖還欽點了一人配仁廟，就是原蘇州知府況鍾，雖然況鍾品級不高，僅僅是三品，遠遠比不上這些部堂大員或者是閣輔臣，但是況鍾作為大明循吏的代表，朱載坖認為仍然是有很重要的意義的，通過將況鍾配太廟，向天下的員們傳達一個信息，就是配太廟並非是高級員們的專利，只要能夠向況鍾那樣，積極任事，為朝廷，為百姓辦事，朝廷依舊會予以加賞。

在商量完了這些事之後，朱載坖宣布在閣的領導之下，會同翰林院、都察院、吏部、禮部、兵部、國史館等相關衙門，共同確定配太廟的人選。

不過朱載坖現在最關心的就是配太廟的武臣，朱載坖很清楚，雖然朱載坖三令五申，在選擇配太廟的功臣上，不分文武，惟以功績論，但是朱載坖很清楚，指這幫大明文們干這件事，顯然是不太可能的，他們不有文武之爭，還有門戶、出、鄉里、學派等各種各樣的分歧，在配太廟這麼大的榮耀面前，雖然文們部有各種各樣的矛盾，但是如果朱載坖不加以干預的話，那是肯定會整出一份讓朱載坖很無語的名單的。

朱載坖於是召集勛臣、參贊軍務大臣們，一道在一旁商量應該讓那些勛臣武將配太廟，第一個就是保國公朱永，作為繼張輔之後勛臣中能夠拿的出手的名將，朱暉也算是非常不錯的將領了，前後八佩印，征荊襄、延綏、建州諸賊，戰果也算是說的過去了，讓朱永配憲宗皇帝，也算是一個不錯的選擇。

除此之外，勛臣們還向朱載坖舉薦定襄伯郭登，他是郭英的曾孫，也是勛貴武將中的佼佼者，土木之變中，郭登奉命隨從護衛至大同府，被超拜為都督僉事、參將，輔助廣寧伯劉安鎮守大同。七月，國公朱勇等戰死於鷂兒嶺，英宗及群臣倉促商議回師之事，郭登向隨行的閣臣曹鼐、張益建議從紫荊關回師，但是不聽。

等到英宗被俘，也先率軍帶着英宗在大同索要財的時候，郭登與劉安及侍郎沈固、給事中孫祥、知府霍瑄等出城拜謁，伏地痛哭，將二萬餘兩白銀及宋瑛、朱冕、臣郭敬的家產進獻給英宗，以賜給也先等。這天晚上，敵軍在城西紮營。郭登企圖派銳前去劫營迎駕，可惜沒有功。

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