話說有一年，整個福建都發生了大瘟疫，林默娘的母親王氏在這場瘟疫中死去。

林默來聽說在湄洲島的南面有個無人居住的荒島，這個荒島有很多毒蛇猛和妖怪，所以人們稱呼為魔島。

而在這個魔島上，有一座山，據說這個山是太上老君的葫蘆所化，山裡有千年的鐘石水，這個這個水能治療這個瘟疫。

魔島由嘉應、嘉佑兩兄弟的養的兩個大蛇看管着。

林默娘元神出竅飛到魔島，與兩個大蛇怪鬥起來，用銀鐲子法敲擊兩個大蛇，然後用銅符把兩個大蟒蛇打得腦漿迸裂。

林默娘除掉這兩個蛇妖，然後了魔島的山裡，用施法的瓶子把治療瘟疫的聖水裝了進去，然後飛到天空，施法把聖水融天空的雲層里，然後施法下雨，解除了這場瘟疫災難。

林默娘已過及笄之年，父親想着讓嫁人，但是立志終不嫁，決定一心向善，奉獻一生於救助海上的生命。

林默娘二十一歲那年，莆田遇上了百年未見的大旱。當地河流乾涸了，樹木大多枯萎，田裡的禾苗都枯焦了，黎民百姓苦連天。

城的父老鄉親紛紛到縣衙，請求縣尹大人方市琪親自前往湄洲，求林默娘設壇祈雨。

這個縣尹方市琪，平素就貪婪歹毒，百姓對其怨聲載道。

方市琪本來就不願意降低自己份去請求一個漁家，但是怕旱嚴重，若是百姓因此陷於絕境，發生了變，或者因此上告朝廷，朝廷怪罪下來，自己的職就不保了。縣尹大人方市琪迫於無奈，只好帶上了幾個跟班，冒着酷暑的天氣，來到了湄洲。

縣尹方市琪見過林默娘，說明了自己的來意，求儘力施法，祈雨解除乾旱。

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