儘管拉頓的實力實在難以令人恭維，其表現也着實令人大失所，最終未能如願地拖住基多拉前進的步伐。然而，為了能夠徹底制服這隻頑強抵抗的拉頓，基多拉亦被迫無奈地降低了自原本高高在上的飛行高度，致使它那無比巨大且沉重的軀逐漸靠近波濤洶湧的海面。就在此刻，一直在海中追不捨、苦苦尋覓着最佳攻擊時機的哥斯拉，猶如一頭蟄伏已久的猛虎般驟然發襲擊！只見它猛然躍出水面，張開盆大口死死咬住了基多拉其中的一顆腦袋，並憑藉強大的力量生生地將基多拉整個兒拖拽進深邃無垠的大海之中。

倘若說廣袤無垠的天空乃是屬於基多拉的主戰場，那麼波瀾壯闊的海洋無疑便是哥斯拉稱雄稱霸之地。在這片悉得不能再悉的領域戰鬥，哥斯拉如魚得水，充分發揮出自得天獨厚的主場優勢，輕而易舉便功咬斷了基多拉左側那顆猙獰可怖的頭顱。剎那間，猩紅的鮮如同噴泉一般從傷口噴涌而出，瞬間染紅了周圍一大片海域。

接着，這兩頭型碩大無比的巨在茫茫大海深展開了一場驚心魄、生死攸關的激烈鏖戰。在被基多拉的引力線照亮的海水中，它們相互糾纏廝打在一起，每一次撞擊都引發滔天巨浪，彷彿要將整個世界都吞噬殆盡。而在此過程當中，基多拉曾數次企圖掙束縛逃回天際之上，但每次都被早有防備的哥斯拉及時察覺並果斷出手阻攔，迫使它只能繼續留在汪洋大海之中與哥斯拉決一死戰。

與此同時，在戰場的另一側，人類軍隊面凝重地搬出了他們心研製多時、視為終極殺的神秘武——氧氣毀滅者。這一秘武凝聚了人類科技的華與心，其設計初衷便是要藉助它來摧毀特定區域的所有氧氣分子，進而殺死還是地球生的泰坦巨。軍方希用這個秘武將哥斯拉和基多拉這兩隻龐然大置於死地。

帝王組織見狀大驚失，深知此舉可能帶來無法預料的後果，於是匆忙上前試圖阻攔軍方的行。然而，軍方早已下定決心，對帝王組織的勸告充耳不聞，毅然決然地按下了啟按鈕，發出了那威力驚人的氧氣毀滅者。

剎那間，只見一道耀眼的芒劃破天際，徑直墜哥斯拉與基多拉激戰正酣的海水中。接着，一陣驚天地的巨響傳來，彷彿整個世界都為之抖。伴隨着劇烈的衝擊波，大量的水花騰空而起，形一片遮天蔽日的水霧。

當硝煙漸漸散去，人們驚恐地發現，原本波濤洶湧的海面此刻變得異常平靜，無數條魚兒翻着肚皮漂浮在水面上，顯然已經失去了生命跡象。而剛才還打得難解難分的哥斯拉和基多拉，此時竟也毫無聲息不知生死。

正當眾人皆以為這場驚心魄的戰鬥以兩敗俱傷收場之時，突然間，原本風平浪靜的海面再度掀起波瀾。只見基多拉如同一道閃電般從海中猛然竄出，張開巨大的翅膀，向著天空疾馳而去。它那猙獰的面容出無盡的憤怒與威嚴，彷彿在向世人宣告：我才是這片天地的主宰！

氧氣毀滅者居然對基多拉無效，這時候帝王組織的飛行航母里，一個工作人員從數據庫里記錄的古老壁畫上找到了端倪。據壁畫上記載，基多拉是從天上降臨的巨龍，也就是說，基多拉這貨就不是地球本土種，而是外來侵的宇宙生，其生理構造與地球生有很大區別，對於氧氣，本沒有地球生那麼需要，甚至基多拉的組織里有沒有氧氣分子也要打個問號。怪不得氧氣毀滅者可以重創哥斯拉，而基多拉除了被哥斯拉咬掉一個頭，本沒收到傷害。

這下完蛋了，原本還有哥斯拉可以對抗基多拉，可因為人類自己作死，沒有幹掉基多拉反而重創了哥斯拉，哥斯拉到現在都沒什麼反應，估計已經涼了。不過人類還沒有絕，因為應龍在趕來的路上了，人類是知道應龍庇佑了骷髏島的，人類認為應龍是善良的泰坦巨，因為哥斯拉可能已經涼了，所以在人類心裡應龍是戰勝基多拉最後的希了。

基多拉從海里沖了出來，拖着傷的飛到了拉頓沉睡的火山上，此時基多拉左邊被哥斯拉咬掉頭顱的脖子的斷面創口已經被一層明的白包裹。過白可以看到裡面有骨頭和在快速再生。基多拉中間的頭顱用咬住包裹在斷面創口上的白，把它從創口上撕了下來。創口上先是一條舌頭出，接着是森白的下頜骨然後是上頜骨，接着就是再生，最後是金黃的鱗片重塑，一個新的頭顱在基多拉強悍的再生能力下快速再生。不過也許是再生的，這個新頭顱和另外兩個頭顱比有些獃頭獃腦。

很快，基多拉上的傷就被它憑藉自己強悍的再生能力恢復了。恢復了傷勢的基多拉，接下來的作卻彷彿在進行什麼神秘的儀式一樣，只見基多拉將自己的雙翼展開高舉，三個龍頭仰天發出清越悠揚的龍，伴隨着神秘的波快速席捲全球。這是阿爾法級別的泰坦巨的獨有技能——阿爾法召喚

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