面對洶洶的士林輿和街頭示威，負責留都（南京）防務的鎮守太監劉福和世襲罔替的魏國公徐文爵（或其子弟），都到了巨大的力。他們想要調南京的衛戍部隊控制局勢，卻發現困難重重。原來，按照制度，大規模調南京守軍，需要兵部尚書、守備勛臣、鎮守太監三方的印信齊全方可。而此時，南京兵部尚書史可法，正奉旨督師江北，防備左良玉等軍閥，人不在南京。缺了一印，劉福和徐文爵都不敢擅自調兵，生怕日後被言彈劾，擔上“矯詔”的罪名。南京的僚系，在關鍵時刻，再次顯現出其僵化和低效。

消息傳回北京，崇禎皇帝然大怒！“好一群不知死活的江南腐儒！國難當頭，不思報國，反而在此興風作浪，非議朝政！真以為朕的刀，砍不到江南嗎？！”

他立刻做出反應，一方面，任命素來與東林、復社不睦的馬士英為南京吏部尚書，派去整頓南都場；另一方面，則令劉福、徐文爵，讓他們不必顧忌程序，與馬士英配合，對那些帶頭鬧事的復社學子，“便宜行事”，該抓就抓，該殺就殺！絕不姑息！

至於北京城，雖然也有些許士子對皇帝的新政不滿，但在經歷了之前的腥鎮後，加之三廠一衛的嚴監控，早已無人敢公然聚集滋事，市面暫時保持着一種高下的“平穩”。

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就在崇禎皇帝忙於應對部的政治風波和推行改革之時，南線的軍，卻再次傳來噩耗。

負責從南面迂迴包抄京師的劉芳亮所部大順軍，一路北上，抵達了京南重鎮霸州。然而，等待他們的，並非堅固的城防和頑強的抵抗，而是一座幾乎不設防的空城！

原來，駐守霸州的明軍，早已接到了崇禎皇帝下達的“放棄外圍、集中兵力、堅壁清野”的旨意，在稍作抵抗、掩護百姓和資撤離後，便已提前向京師南郊的李家村大營方向收。

劉芳亮幾乎兵不刃地便佔領了霸州城。大順軍的旗幟，取代了飄揚數百年的大明玄鳥旗，上了霸州的城樓。

城的文們，在軍奉詔撤退後，陷了巨大的恐慌。大部分員選擇了拖家帶口，隨着難民，倉皇逃往京師。但也有一部分員，心存幻想，留了下來，準備效仿前朝舊例，簞食壺漿，迎接“新主”，希能被大順軍“量才錄用”，繼續自己的宦生涯。

然而，現實是殘酷的。沖城中的大順軍士兵，許多本就是被造反的民或野的潰兵，他們對這些平日里作威作福的“老爺”充滿了憎恨。那些試圖“歸順”的文，非但沒有得到禮遇，反而大多遭到了暴的對待，家產被洗劫一空，本人也盡凌辱。直到這時，他們才幡然醒悟，流寇終究是流寇，改朝換代並非請客吃飯，他們的幻想是何其天真！但一切，都為時已晚。

劉芳亮本人在城後，問了被俘的霸州知州，才得知明軍主力早已奉皇帝之命撤走，自己攻下的不過是一座戰略放棄的空城。他不嘆：“這崇禎皇帝，倒是比想象中更乾脆！直接棄城而去，倒讓某家這順勢取城，顯得有些……無趣了。” 但同時，明軍這種主收、集中兵力的舉，也讓他意識到，接下來的京師攻防戰，恐怕不會輕鬆。他下令大軍稍作休整，隨即繼續揮師北上，兵鋒直指李家村大營和京師南郊！

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