主腦，是恩雅之神，是所有恩雅人最後的棲息之地，其他的分支腦已被全部消滅。它是由100億個獨立的恩雅人的意識組的，這個數量還不足恩雅文明鼎盛時期的十分之一。艾麗母親和的其他11個姐妹也在其中，們是由主腦選中，將意識輸送到恩雅人中，來完現實世界中的任務的。們自願將自己的全部意識由主腦監控，這對恩雅人而言，是最大程度的犧牲。因此，主腦可以知母親、人類孩子以及所有機人的甚至意識，並可以授意甚至直接控制（它）們在現實的世界中完工作。在這12個實的恩雅人中，艾麗的母親又是一個特殊的角，除了和其他姐妹一樣，擁有5個可以縱機人工作的孩子外，還擔任着單獨培育的兩個特殊孩子---觀察者的功能。同時，在的大腦中有一塊單獨的區域用來理和這兩個孩子的連接，這個區域與其他區域獨立運作，並沒有和主腦實時地連接在一起。只有主腦想要知道相關容的時候，才會通過與大腦其他區域的換，將記憶傳遞給主腦。這樣做的目的，是為了避免未經理的混信息，干擾到主腦理那些海量的數據，簡單來說，就是怕主腦分心。

在正常的保育文明中，通常不會將主腦主前置到與被保育文明如此近的距離上，而只是派出一個分支，這個分支一般只有一至二百萬個意識，且在資源充足的況下，會有約十萬個個意識進實並與被保育的重要實連通，用以檢測和記錄初級文明的發展進程，在一些關鍵的進程中施加影響，以避免產生災難的事件發生。可這次恩雅文明的任務十分特殊，不僅時間迫，同時在可用資源到幾乎很難維持自生存的況下，還要完引導人類開展合作建造裝置的工作。這在某種程度上已經拋棄了保育文明的行為準則，但主腦卻不得不做，因為在其他星系中，恩雅的保育工作全都失敗了，文明生存的外在環境遭到了毀滅的打擊。好在，所有分支腦與主腦之間，也是通過量子糾纏應進行連接的，主腦保存了所有毀滅的分支腦的備份，使得所有重要的意識個得以留存。後來，主腦所在的恆星系，再一次經歷了毀滅的打擊，在逃亡到地球之前，為了適配這艘小小的恆星飛船的承載量，主腦對意識主進行了一次清洗，90%以上被評定為作用較弱的個意識被永遠刪除了，這是文明的另一次重大損失。現在，雖然保育地球上的人類，可以令恩雅人短暫得以延續，但主腦經過推算，這支人類也將不可避免地迎來進化失敗的結局。現在恩雅人唯一的出路就是，最終放棄保育任務，全力建造並功運行裝置，才能在這個撿來的地球文明失敗前，得到赦免的機會。當然，這些艾麗他們並不知道。

主腦還有一個麻煩，那就是人工智能，它是養在籠子里的惡魔。但恩雅文明發展到現在的階段，已經無法與這個惡魔徹底分開了。主腦犧牲的那幾百億個意識主，節省出來的飛船載荷，就是為了容納下那台恩雅超級電腦。主腦與電腦的意識---主機達了協議，在來到地球後，主機會配合恩雅人建立計算模型，從而實現對現實世界的深度模擬。作為換，主機擁有模擬世界中底層的部分控制權，用來培育電子意識。主腦明白，任由主機這樣發展下去，恩雅人終將會再次面臨，被人工智能徹底清除的危險境地，但主機將所有希全部寄託於裝置的功，它已別無選擇。

現在，主腦屈居於月球部那艘小小的恩雅飛船之中，能夠維持恩雅人實的最大的數量只有12個，它通過推演，將這12個實和他們的連接，幾乎全部用於建造工作。只在艾麗母親這個能力最強的個中，加了兩個觀察者，最初的目的，是為了讓他們在關鍵的時刻，發揮影響人類進程的作用。但是，經過評估，認為兩個人的影響力太小，只能讓他們作為主腦功能的補充，在60個用於建造和維持運行系的連接之外，擔任秘的預備力量。

主腦掌握的地球上人類的信息是，這裡的人類彷彿經歷過多的文明的失敗重啟，再失敗再重啟的過程，這與恩雅這個保育文明只要失敗，就會連同星系一起被消滅的苛刻境完全不同。在恩雅人到來之前，目前這個人類文明還於野生狀態，文明的記憶只有約6000年。在這不長的文明發展過程中，他們似乎也被保育過，卻大約在2000年以前，不知因為什麼原因，被原有的保育文明拋棄了。一些曾經被連接過的個的後代藏在人類之中，創建了一個神秘組織---榮會，他們仍然保留着古老的信仰，遵循着一些規則，秘地控制着人類發展。

這個榮會的長老在恩雅飛船到達太系，展示了震懾力量並拯救了2800個垂死的人類志願者後，聯繫上了恩雅人，與主腦達了契約，幫助恩雅人瓦解舊的人類國家政權和武裝力量，組建代表全人類的統一政府後，將人類的控制權移給人類政府，由它代表全人類與恩雅人簽訂了建造裝置的協議。協議簽定之後，由榮會控制的企業，作為獨立於政府的秘力量，和政府一起保證人類協議的履行。作為換，恩雅人在地球的一個秘地點，為榮會的員建立了一個類似主腦的超級電腦，以幫助他們獲得永生。