然而，王允接下來的舉措，卻暴了他政治上的短視與剛愎。他沉浸在誅殺國賊、匡扶社稷的巨大功喜悅中，迅速變得志得意滿，甚至有些剛愎專斷。

對於如何理龐大的西涼軍余部，朝中出現了分歧。有人建議安為主，授予李傕、郭汜等人職，令其各安其位，逐步消化。但王允及部分激進的朝臣認為，董卓已死，西涼軍失去主心骨，應趁勢徹底剷除，以絕後患。尤其是呂布，對西涼軍恨之骨（既有舊怨，也因西涼將領排他），極力主張武力清剿。

最終，王允採納了強派的意見。他命呂布率領并州舊部及部分反正的軍，迅速出兵，攻破董卓的老巢郿塢。呂布正發泄心中積怨，欣然領命。

郿塢雖堅，但主君新喪，守軍人心惶惶。呂布驍勇，很快攻破塢堡。他下令將董卓家族不分老，盡數屠戮，董卓九十老母亦未能倖免。又從塢中搜出大量金銀財寶、糧食布匹，一部分充公，一部分則被呂布及其部下私分。郿塢的陷落和董氏滅族，固然一定程度上平息了長安百姓對董卓的滔天怨恨，百姓甚至“歌舞於道”，但如此酷烈的手段，也令原董卓部將，尤其是李傕、郭汜等手握重兵在外者，到兔死狐悲，人人自危。

更讓西涼軍將領不安的是王允後續飄忽不定、出爾反爾的政令。他先是赦免眾人，旋即又因一些小事或風聞，對原董卓部下員將領橫加指責，罷黜甚至死數人。對於如何安置李傕、郭汜等擁兵在外的將領，王允更是猶豫不決，既想削其兵權，又怕激起兵變，命令朝令夕改，時而召其朝（意圖或奪權），時而又令其留守原防，充滿了猜忌和不信任。

長安城，王允與呂布把持朝政，排其他功臣（如士孫瑞等），對西涼降卒或原董卓部下多有折辱。王允本人也因大功告，聽不進不同意見，理政務全憑個人好惡，使得朝政並未如預期般清明，反而陷新的混和不確定之中。

消息傳到駐守在陝地、潼關等的李傕、郭汜、張濟、樊稠等人耳中，這些原本因董卓之死而驚慌失措、打算上表請降的將領，頓時陷了巨大的恐懼和疑慮之中。

“王允先赦後殺，言而無信！”

“呂布那廝，與我等素來不睦，如今得勢，豈能容我？”

“董太師（他們仍稱董卓）家族盡滅，我等若回長安，豈不是羊虎口？”

“聽說王司徒盡誅涼州人！”

種種流言和猜忌，在驚魂未定的西涼軍將領中迅速蔓延。他們手握兵權，卻到前途未卜，生死懸於他人一念之間。投降？恐怕是自投羅網。解散軍隊逃亡？世之中，失去軍隊如同待宰羔羊。反叛？董卓剛死，朝廷似乎又有呂布這等猛將……

。日終可不惶惶，起一在集聚人等汜郭、傕李