鄭芝龍的發跡和繼承思齊的產有很大的關係。而台灣的勢力也是思齊留下的產之一。

思齊是當時縱橫中日海域的大海主，從事着貿易和海上掠奪。當時其手下有十個主要首領，包括楊天生、張弘、林福、林翼、李俊臣、陳衷紀和鄭芝龍等人。

思齊和當時很多著名的海主一樣，都以日本作為自己的主要據地。隨着幕府的威權不斷加重。首領思齊未雨綢繆，考慮要在日本以外建立自己的據地。

在中國沿海的島嶼建立據地，可選的地方很多，但是明王朝的餘威猶存，軍事力量也沒有衰落到後來那樣不堪一擊的地步，閩浙沿海等地的島嶼無法染指――雙嶼就是前車之鑒。即使是澎湖。荷蘭人幾次築壘，幾次都被明軍驅逐，所以他們只能選擇海外的孤島――“化外之地”台灣就這樣進了他們的視線。

1624年思齊率領部下和移民前往北港，在當地建立營寨，從大陸招納漳泉移民在此拓荒墾。第二年九月，思齊在諸羅山行獵時候據說因為冒死在當地。

思齊的突然死去，頗有疑點，但是不管怎麼樣，年僅二十一歲的鄭芝龍繼承了思齊的首領位置，得到了思齊的大部分產。

鄭芝龍繼承思齊的首領地位後，沒有在台灣的拓展墾上下很大的力氣。荷蘭人在台灣勢力擴展很快，加上西班牙人也來了一腳：1626年西班牙人在基隆附近築了聖?薩爾瓦多城。這兩年後，西班牙又在現在的淡水築了聖?多明哥城。鄭芝龍當時正於和各大海上勢力不斷戰，爭奪海上霸權的時候，不願意多蹚渾水，一度決定放棄在台灣的移民據點，撤回福建。後來他還是放棄了這一念頭，改為繼續經營台灣，1628年閩南遭到大旱，民甚眾。鄭芝龍在熊文燦支持下，招納漳、泉等地災民數萬人，“人給銀三兩，三人給牛一頭”，用海船運到北港墾荒定居。大大擴展了在台灣的福建移民的數量和勢力，

不過，至始至終，鄭芝龍始終沒有派遣武裝力量到台灣去，也沒有明確的宣示對台灣的所有權。他只是支持在台福建移民中的首領，通過他們來遙控當地的移民村落――不過這些年來他也並沒有多干涉當地的事務。荷蘭人向中國人收取人頭稅，他也未作出干涉。

通過當地的墾主，鄭芝龍繼續控制着北港――大陸移民最早的登陸開發地區。在荷蘭人統治區域的郭懷一幾乎每個月都會寫信給他，報告當地況。郭懷一作為當地的華人領袖，荷蘭人在當地的許多行政事務必須依賴於他，因而荷蘭人在當地的一舉一，貿易狀況，鄭芝龍幾乎了如指掌。

荷蘭人暗中勾結劉香，給予支持的報他早就有所掌握，但是現在，他還下不了和荷蘭人翻臉的決心。

荷蘭人是首鼠兩端，對劉香同樣是三心二意的，絕不會真得出力――他們的唯一目標就是左右逢源，保持海面上的制衡。如果立刻翻臉，只會迫荷蘭人公開站到自己的對立面去。

他鄭芝龍雖然並不畏懼荷蘭人的實力――幾年前他就教訓過荷蘭人――但畢竟也不是以戰爭為樂的人：他首先是個商人。如果荷蘭人真得站到了他的對立面，竭力在船、炮上支援劉香，會給他帶來很大的麻煩。

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