此時的明軍哪裡是小小的哈能夠抵擋的，哈城很快被攻破，兀納失里向西逃亡，並向明廷上貢請罪，自覺為明朝的藩屬國。

然而蒙元時期的西北戰太多，殺伐過重，使得河西地區幾乎了赤地千里的無人區，明軍暫時無力在此規模駐軍。於是明軍打下哈城，迫兀納失里服後就撤退了。

1397年，朱元璋在今新疆和田地區設置罕東衛，對當地進行羈縻統治，進而完對哈地區的包圍。

明祖朱棣即位後，承繼了經略西北的方針。

1403年，他派遣使臣亦卜剌金前往哈諭哈國新王安克帖木兒。當時朝臣提議延續元朝的做法，將他封為肅王，以彰顯明朝取代元的統治後能夠繼承元的版圖。但是朱棣覺得封他一個新的王，不影響我承繼西北疆土，於是在1407年將安克帖木兒封為忠順王，意在突出哈對明朝的忠順之心。

儘管在名義上進行了冊封，明廷對哈國的控制力還不強。而草原上的韃靼首領鬼力赤與明朝作對，不滿哈屬明朝，派人將安克帖木兒毒死。

朱棣在派人去徵得哈地方勢力的同意後，將多年前俘獲的哈王子送到哈，繼承忠順王的王位。

然而當地勢力只是因為畏懼明朝的勢力而同意繼承王位的，心並不認可這位新主。

哈舊王母為代表的地方勢力在上位後，採取各種手段排他，最終將他趕出了哈。

朱棣原本是想搞區域自治，只要你們認同當王，其他的事你們都可以自已做主，朝廷不加干涉。結果當地勢力敬酒不吃吃罰酒，朱棣下詔狠狠訓斥了王母與大小頭目。

為了保證對哈的控制力，朱棣在哈設置新的哈衛，派長史、紀善等朝廷員協助管理哈，實際上是替把控哈的政務和律法。

有員提議在哈駐軍，設置把總之職。但是朱棣出於懷遠人的思想，考慮到當時沒有能夠威脅明朝西北疆域的勢力，而哈本地的政局和民族關係又比較複雜，拒絕了這一建議。

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